Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDFIP2Q9NV92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms