Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms