Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms