Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCM2LQ9NUG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms