Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECHDC1Q9NTX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms