Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLE3Q9NRF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE3Q9NRF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms