Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf4Q9NR00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms