Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM10Q9NQV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM10Q9NQV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms