Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC52A3Q9NQ40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms