Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE2Q9NQ36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms