Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB9BQ9NP90 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB9BQ9NP90 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB9BQ9NP90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms