Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9N2J8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9N2J8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9N2J8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9N2J8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9N2J8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9N2J8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9N2J8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9N2J8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9N2J8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9N2J8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9N2J8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9N2J8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9N2J8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9N2J8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9N2J8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9N2J8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms