Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLMPQ9H6B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms