Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC68Q9H2F9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC68Q9H2F9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms