Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHD4Q9H223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD4Q9H223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms