Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H12CQ9C0D7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZC3H12CQ9C0D7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms