Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL3Q9BXA9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SALL3Q9BXA9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms