Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM2Q9BVW6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms