Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHF20Q9BVI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF20Q9BVI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms