Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM43Q9BTV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms