Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFJQ9BTM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms