Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TINF2Q9BSI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TINF2Q9BSI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TINF2Q9BSI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TINF2Q9BSI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TINF2Q9BSI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TINF2Q9BSI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms