Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms