Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms