Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF25Q9BQ70 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms