Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf43Q9BQ61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms