Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL2Q99962 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL2Q99962 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL2Q99962 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms