Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRX2Q99811 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRX2Q99811 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRRX2Q99811 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms