Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS8Q99627 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms