Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP4Q99569 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms