Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms