Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SIN3AQ96ST3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIN3AQ96ST3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms