Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP1R9BQ96SB3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R9BQ96SB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms