Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WRNIP1Q96S55 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WRNIP1Q96S55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WRNIP1Q96S55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WRNIP1Q96S55 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
WRNIP1Q96S55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms