Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UIMC1Q96RL1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms