Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK15Q96Q40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms