Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNT1Q96Q11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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