Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF488Q96MN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms