Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JSRP1Q96MG2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms