Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPZA3Q96KX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms