Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IMP4Q96G21 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms