Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC97Q96F63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms