Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPTNQ96CV9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OPTNQ96CV9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms