Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC8Q96B26 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC8Q96B26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms