Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYAP1Q96A49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYAP1Q96A49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms