Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35C1Q96A29 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC35C1Q96A29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms