Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOCS4Q8WXH5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SOCS4Q8WXH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOCS4Q8WXH5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms