Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL1Q8WXF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms