Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKA2Q8WVK7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKA2Q8WVK7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms