Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC12Q8WUD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC12Q8WUD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms